Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpsf3Q9QXK7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpsf3Q9QXK7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms