Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms