Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Homer2Q9QWW1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms