Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcea2Q9QVN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcea2Q9QVN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms