Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms