Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms