Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rabgef1Q9JM13 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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