Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc4apQ9JLV2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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