Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd1aQ9JLR9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms