Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CubnQ9JLB4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CubnQ9JLB4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms