Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prg3Q9JL95 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prg3Q9JL95 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms