Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgn5Q9JL35 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgn5Q9JL35 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms