Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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