Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scamp4Q9JKV5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms