Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms