Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx6Q9JKK1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms