Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms