Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nectin1Q9JKF6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms