Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scamp5Q9JKD3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms