Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ybx3Q9JKB3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms