Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnga3Q9JJZ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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