Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx20Q9JJY4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms