Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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