Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssna1Q9JJ94 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssna1Q9JJ94 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssna1Q9JJ94 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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