Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc86Q9JJ89 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms