Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms