Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM1

Slc29a1, Equilibrative nucleoside transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a1Q9JIM1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc29a1Q9JIM1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc29a1Q9JIM1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms