Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc22Q9JIG7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms