Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm9sf3Q9ET30 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm9sf3Q9ET30 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms