Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1Q9ESG2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms