Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtofQ9ESF1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtofQ9ESF1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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