Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aff4Q9ESC8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms