Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ush1cQ9ES64 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms