Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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Usp29Q9ES63 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp29Q9ES63 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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