Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a4bQ9ES61 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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