Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb2Q9ERK7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms