Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc28a3Q9ERH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms