Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lima1Q9ERG0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms