Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Barx1Q9ER42 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms