Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx12Q9ER00 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms