Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rapgef4Q9EQZ6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms