Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst3Q9EQH7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst3Q9EQH7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms