Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cxcr6Q9EQ16 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms