Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SgshQ9EQ08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SgshQ9EQ08 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms