Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms