Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tlr1Q9EPQ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tlr1Q9EPQ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms