Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl4Q9DCU6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms