Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde1Q9DBZ9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms