Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc97Q9DBT3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms