Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcg8Q9DBM0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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